课题组长
姓名：
Tomoyasu Sugiyama助理教授 研究员 博士生导师, PhD, 助理教授
职务：
所在院所：
威尼斯432888can
荣誉称号：
教育经历：
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1993/04—1997/03，日本东北大学，学士
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1997/04—1999/03，日本奈良先端科学技术大学院大学，硕士
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1999/04—2003/03，日本大阪大学，博士
博士后及工作经历：
- 2003/04—2007/12，美国国立卫生研究院，Visiting Fellow
- 2008/01—2013/03，日本筑波大学，助理教授
- 2013/04—2014/03，日本筑波高等研究联盟中心，研究员
- 2014/08—2017/07，美国国立卫生研究院，Research Fellow
- 2017/08—至今， 威尼斯432888can，威尼斯432888can，助理教授（TENURE-TRACK）
课题组简介
研究内容：
我们实验室主要研究由液液相分离介导的生物凝聚体功能。我们已经研究了以下几个方面：（1）核内凝聚体卡哈尔体（the Cajal body）如何正向调控细胞的静息期；（2）核内形成核体的RNA结合蛋白如何加速组成型异染色质的形成；以及（3）另一种核内凝聚体——解理体中富集的因子介导的RNA的选择性降解。
研究成果展示
在之前的工作中，我们研究了RNA干扰（RNAi）如何介导异染色质组装，以及一个组蛋白去乙酰化复合体如何在异染色质处抑制转录发生。之后，我们将研究方向转向核内生物凝聚体，并识别和鉴定了重要的RNA降解复合物，MTREC和EMC。我们惊喜地发现，这个核内RNA降解复合物能够避免单亲二体性的发生（一种两条染色体拷贝来自同一个亲本的遗传现象），这种异常可能导致人类疾病的发生。最近，我们鉴定了粟酒裂殖酵母中的Coilin蛋白同源物，它是卡哈尔体（Cajal body）的组织者，并揭示了Coilin对于细胞静息期的重要性。细胞静息期是一种特殊的细胞周期，细胞不进行分裂但在适当条件下仍能重新进入细胞周期。总之，我们的研究致力于理解真核细胞中核体所承担的角色。
代表性论文（*第一作者，#通讯作者）
- 1. Deng, Xiaoling*; Yao, Qinglian; Horvath, Attila; Jiang, Ziling; Zhao, Junjie; Fischer, Tamas; Sugiyama, Tomoyasu#; .The fission yeast ortholog of Coilin, Mug174, forms Cajal body-like nuclear condensates and is essential for cellular quiescence.NUCLEIC ACIDS RESEARCH. 01 Jun 2024.
- 2. Wang, Xindi*; Xu, Ruoming; Wang, Yichen; Liu, Ziyue; Lou, Ronghui; Sugiyama, Tomoyasu#; .Yesprit and Yeaseq: Applications for designing primers and browsing sequences for research using the four Schizosaccharomyces species.YEAST. Nov 2021. 38(11):583-591.
- 3. Marayati, Bahjat F.*; Tucker, James F.; De La Cerda, David A.; Hou, Tien-Chi; Chen, Rong; Sugiyama, Tomoyasu; Pease, James B.; Zhang, Ke#; .The Catalytic-Dependent and -Independent Roles of Lsd1 and Lsd2 Lysine Demethylases in Heterochromatin Formation in Schizosaccharomyces pombe.CELLS. Apr 2020. 9(4).
- 4. Taneja, Nitika*; Zofall, Martin; Balachandran, Vanivilasini; Thillainadesan, Gobi; Sugiyama, Tomoyasu; Wheeler, David; Zhou, Ming; Grewal, Shiv I. S.#.SNF2 Family Protein Fft3 Suppresses Nucleosome Turnover to Promote Epigenetic Inheritance and Proper Replication.Molecular Cell. 6 April 2017.
- 5. Folco, H. Diego*; Chalamcharla, Venkata R.; Sugiyama, Tomoyasu; Thillainadesan, Gobi; Zofall, Martin; Balachandran, Vanivilasini; Dhakshnamoorthy, Jothy; Mizuguchi, Takeshi; Grewal, Shiv I. S.#; .Untimely expression of gametogenic genes in vegetative cells causes uniparental disomy.NATURE. 2017. 543(7643):126+.
- 6. Sugiyama, Tomoyasu*; Thillainadesan, Gobi; Chalamcharla, Venkata R.; Meng, Zhaojing; Balachandran, Vanivilasini; Dhakshnamoorthy, Jothy; Zhou, Ming; Grewal, Shiv I. S.#; .Enhancer of Rudimentary Cooperates with Conserved RNA-Processing Factors to Promote Meiotic mRNA Decay and Facultative Heterochromatin Assembly.MOLECULAR CELL. 2016. 61(5):747-759.
- 7. Zhou, Yang*; Zhu, Jianguo; Schermann, Geza; Ohle, Corina; Bendrin, Katja; Sugioka-Sugiyama, Rie; Sugiyama, Tomoyasu#; Fischer, Tamas#; .The fission yeast MTREC complex targets CUTs and unspliced pre-mRNAs to the nuclear exosome.NATURE COMMUNICATIONS. 2015. 6.
- 8. Sugiyama, Tomoyasu#*; Wanatabe, Nobuyoshi; Kitahata, Eri; Tani, Tokio; Sugioka-Sugiyama, Rie; .Red5 and three nuclear pore components are essential for efficient suppression of specific mRNAs during vegetative growth of fission yeast.NUCLEIC ACIDS RESEARCH. 2013. 41(13):6674-6686.
- 9. Sugiyama, Tomoyasu#*; Sugioka-Sugiyama, Rie; .Red1 promotes the elimination of meiosis-specific mRNAs in vegetatively growing fission yeast.EMBO JOURNAL. 2011. 30(6):1027-1039.
- 10. Sugiyama, Tomoyasu*; Cam, Hugh P.; Sugiyama, Rie; Noma, Ken-ichi; Zofall, Martin; Kobayashi, Ryuji; Grewal, Shiv I. S.#; .SHREC, an effector complex for heterochromatic transcriptional silencing.CELL. 2007. 128(3):491-504.
- 11. Sugiyama, T*; Cam, H; Verdel, A; Moazed, D; Grewal, SIS#; .RNA-dependent RNA polymerase is an essential component of a self-enforcing loop coupling heterochromatin assembly to siRNA production.PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA. 2005. 102(1):152-157.
- 12. Cam, HP*; Sugiyama, T; Chen, ES; Chen, X; FitzGerald, PC; Grewal, SIS#; .Comprehensive analysis of heterochromatin- and RNAi-mediated epigenetic control of the fission yeast genome.NATURE GENETICS. 2005. 37(8):809-819.
- 13. Verdel, A*; Jia, ST; Gerber, S; Sugiyama, T; Gygi, S; Grewal, SIS#; Moazed, D#; .RNAi-mediated targeting of heterochromatin by the RITS complex.SCIENCE. 2004. 303(5658):672-676.
课题组成员及合影
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姓名：宋修怡
身份：工程师
在组时间：2018/02-至今
邮箱：songxy@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：刘子月
身份：博士后
在组时间：2018/01-至今
邮箱：liuzy8@shanghaitech.edu.cn
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姓名：邓小玲
身份：硕士研究生
在组时间：2018/03-至今
邮箱：dengxl@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：赵俊杰
身份：博士研究生
在组时间：202103-至今
邮箱：202103-至今
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姓名：杨荣添
身份：硕士研究生
在组时间：202302-至今
邮箱：yangrt2022@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：郭欣宇
身份：硕士研究生
在组时间：202302-至今
邮箱：guoxy2022@@shanghaitech.edu.cn
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