课题组长
姓名：
杜迪军助理教授 研究员 博士生导师, PhD, 助理教授
职务：
所在院所：
威尼斯432888can
荣誉称号：
教育经历：
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1986/09—1991/07，同济医科大学，学士
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1996/09—1999/07，卫生部北京老年医学研究所，硕士
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2002/08—2007/06，英国杜伦大学，博士
博士后及工作经历：
- 1991/08—1996/08，北京中日友好医院内科，住院医师
- 1999/08—2002/07，卫生部北京医院内科，主治医师
- 2007/07—2008/03，英国牛津大学结构基因学中心，博士后
- 2008/04—2018/08，英国剑桥大学生物化学系，博士后
- 2018/09—至今，威尼斯432888can，威尼斯432888can，助理教授（TENURE-TRACK）
课题组简介
研究内容：
应用冷冻电子显微镜和X-射线晶体学，以及其它生物物理、生物化学和分子动态模拟等方法解析革兰氏阴性病原菌的耐药泵复合物，以及人体锌（Zn+）离子有关的离子通道、转运蛋白和受体的结构，阐述其分子机制，以指导药物的开发。
研究成果展示
1.应用冷冻电子显微镜技术，在世界上第一个解析了完整的细菌耐药泵三联体复合物AcrAB-TolC 的结构，该成果发表在《自然》杂志上。
2.应用冷冻电子显微镜技术解析了一个ABC 类耐药泵三联体复合物MacAB-TolC 结构，该成果发表在《自然- 微生物学》杂上。
代表性论文（*第一作者，#通讯作者）
- 1. Du, Dijun#*; Wang, Zhao; James, Nathan R.; Voss, Jarrod E.; Klimont, Ewa; Ohene-Agyei, Thelma; Venter, Henrietta; Chiu, Wah; Luisi, Ben F.#.Structure of the AcrAB-TolC multidrug efflux pump.NATURE. 2014. 509(7501):512.
- 2. Du, Dijun*; Wang-Kan, Xuan; Neuberger, Arthur; van Veen, Hendrik W.; Pos, Klaas M.; Piddock, Laura J. V.; Luisi, Ben F.#.Multidrug efflux pumps: structure, function and regulation.NATURE REVIEWS MICROBIOLOGY. 2018. 16(9):523-539.
- 3. Fitzpatrick, Anthony W. P.*; Llabres, Salome; Neuberger, Arthur; Blaza, James N.; Bai, Xiao-Chen; Okada, Ui; Murakami, Satoshi; van Veen, Hendrik W.; Zachariae, Ulrich; Scheres, Sjors H. W.#; Luisi, Ben F.#; Du, Dijun#.Structure of the MacAB-TolC ABC-type tripartite multidrug efflux pump.NATURE MICROBIOLOGY. 2017. 2(7).
- 4. Wang, Zhao*; Fan, Guizhen; Hryc, Corey F.; Blaza, James N.; Serysheva, Irina I.; Schmid, Michael F.; Chiu, Wah#; Luisi, Ben F.#; Du, Dijun#.An allosteric transport mechanism for the AcrAB-TolC multidrug efflux pump.ELIFE. 2017. 6.
- 5. Du, Dijun#*; Neuberger, Arthur; Orr, Mona Wu; Newman, Catherine E.; Hsu, Pin-Chia; Samsudin, Firdaus; Szewczak-Harris, Andrzej; Ramos, Leana M.; Debela, Mekdes; Khalid, Syma#; Storz, Gisela#; Luisi, Ben F.#.Interactions of a Bacterial RND Transporter with a Transmembrane Small Protein in a Lipid Environment.STRUCTURE. 02 Jun 2020. 28(6):625-+.
- 6. Harris, Andrzej*; Wagner, Manuel; Du, Dijun; Raschka, Stefanie; Nentwig, Lea-Marie; Gohlke, Holger; Smits, Sander H. J.; Luisi, Ben F.; Schmitt, Lutz.Structure and efflux mechanism of the yeast pleiotropic drug resistance transporter Pdr5.NATURE COMMUNICATIONS. 2021. 12(1).
- 7. Shi, Xiaodong*; Chen, Muyuan; Yu, Zhili; Bell, James M.; Wang, Hans; Forrester, Isaac; Villarreal, Heather; Jakana, Joanita; Du, Dijun; Luisi, Ben F.; Ludtke, Steven J.; Wang, Zhao#.In situ structure and assembly of the multidrug efflux pump AcrAB-TolC.NATURE COMMUNICATIONS. 14 Jun 2019. 10.
- 8. Du, Dijun*; van Veen, Hendrik W.; Murakami, Satoshi; Pos, Klaas M.; Luisi, Ben F.#.Structure, mechanism and cooperation of bacterial multidrug transporters.CURRENT OPINION IN STRUCTURAL BIOLOGY. 2015. 33:76-91.
- 9. Du, Dijun*; van Veen, Hendrik W.; Luisi, Ben F.#.Assembly and operation of bacterial tripartite multidrug efflux pumps.TRENDS IN MICROBIOLOGY. 2015. 23(5):311-319.
- 10. Du, Dijun*; Voss, Jarrod; Wang, Zhao; Chiu, Wah; Luisi, Ben F.#.The pseudo-atomic structure of an RND-type tripartite multidrug efflux pump.BIOLOGICAL CHEMISTRY. 2015. 396(2020-09-10):1073-1082.
- 11. Federici, L*; Du, DJ*; Walas, F; Matsumura, H; Fernandez-Recio, J; McKeegan, KS; Borges-Walmsley, MI; Luisi, BF#; Walmsley, AR#.The crystal structure of the outer membrane protein VceC from the bacterial pathogen Vibrio cholerae at 1.8 angstrom resolution.JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY. 2005. 280(15):15307-15314.
- 12. Borges-Waimsley, MI*; Du, DJ; McKeegan, KS; Sharples, GJ; Walmsley, AR#.VceR regulates the vceCAB drug efflux pump operon of Vibrio cholerae by alternating between mutually exclusive conformations that bind either drugs or promoter DNA.JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY. 2005. 349(2):387-400.
- 13. Neuberger, Arthur*; Du, Dijun; Luisi, Ben E.#.Structure and mechanism of bacterial tripartite efflux pumps.RESEARCH IN MICROBIOLOGY. 2018. 169(2020-07-08):401-413.
- 14. Bruce, Heather A.*; Du, Dijun; Matak-Vinkovic, Dijana; Bandyra, Katarzyna J.; Broadhurst, R. William; Martin, Esther; Sobott, Frank; Shkumatov, Alexander V.; Luisi, Ben F.#.Analysis of the natively unstructured RNA/protein-recognition core in the Escherichia coli RNA degradosome and its interactions with regulatory RNA/Hfq complexes.NUCLEIC ACIDS RESEARCH. 2018. 46(1):387-402.
- 15. Nurmohamed, Salima*; Vincent, Helen A.; Titman, Christopher M.; Chandran, Vidya; Pears, Michael R.; Du, Dijun; Griffin, Julian L.; Callaghan, Anastasia J.#; Luisi, Ben F.#.Polynucleotide Phosphorylase Activity May Be Modulated by Metabolites in Escherichia coli.JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY. 2011. 286(16):14315-14323.
- 16. Gruening, Nana-Maria*; Du, Dijun; Keller, Markus A.; Luisi, Ben F.; Ralser, Markus#.Inhibition of triosephosphate isomerase by phosphoenolpyruvate in the feedback-regulation of glycolysis.OPEN BIOLOGY. 2014. 4(3).
- 17. Tsai, Yi-Chun*; Du, Dijun; Dominguez-Malfavon, Lilianha; Dimastrogiovanni, Daniela; Cross, Jonathan; Callaghan, Anastasia J.; Garcia-Mena, Jaime#; Luisi, Ben F.#.Recognition of the 70S ribosome and polysome by the RNA degradosome in Escherichia coli.NUCLEIC ACIDS RESEARCH. 2012. 40(20):10417-10431.
- 18. 杜迪军#*; 缪竞智; 张秀珍.竞争性PCR内参照菌的构建及应用.CHINESE JOURNAL OF MICROBIOLOGY AND IMMUNOLOGY. Sep 2000. 20(5):442-446.
- 19. 缪竞智*; 杜迪军; 曾平.皮质激素治疗结节病的疗效及 对预后的影响.中华结核和呼吸杂志. Jan 2003. 26(1):14-17.
项目
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1. 细菌多药耐药泵三联体复合物的结构和机制研究，国家自然科学基金委员会，项目负责人
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2. 细菌ABC类多药耐药泵的结构和机制研究，上海市科学技术委员会，项目负责人
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3. 细菌MFS类耐药泵的结构和机制研究，上海市科学技术委员会，项目负责人
课题组成员及合影
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姓名：郭金两
身份：博士后
在组时间：2020/03-至今
邮箱：guojl@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：赵慧敏
身份：博士研究生
在组时间：2019/03-至今
邮箱：zhaohm@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：钟昭君
身份：博士研究生
在组时间：2019/03-至今
邮箱：zhongzhj@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：吐尔逊江·买买提
身份：博士研究生
在组时间：2020/03-至今
邮箱：tuerxunjiangmmt@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：高雪岩
身份：博士研究生
在组时间：2020/03-至今
邮箱：gaoxy1@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：李尚蓉
身份：博士研究生
在组时间：2020/03-至今
邮箱：lishr@@shanghaitech.edu.cn
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姓名：何家园
身份：硕士研究生
在组时间：2021/03-至今
邮箱：hejy2@shanghaitech.edu.cn
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姓名：尚文煜
身份：硕士研究生
在组时间：2021/09-至今
邮箱：shangwy@shanghaitech.edu.cn
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