杨贝, PhD助理教授 研究员 博士生导师

近期科研成果：

1、位于HIV-1病毒表面的Env蛋白三聚体是艾滋病疫苗研发的焦点。我们报道了我国HIV-1病毒的主流亚型（即流行重组亚型CRF01_AE和CRF07_BC）的Env蛋白结构与免疫识别特征，揭示了CRF01_AE亚型的Env蛋白在V1区域的独有特征（图A-B）及其与该亚型的广谱中和抗体逃逸能力之间的关系（图C-D），并阐明了第一株分离自CRF01_AE感染个体的广谱中和抗体的新型中和机制（图E）。该研究拓宽了我们对于HIV-1流行重组亚型的认识，为后续针对我国主流HIV-1亚型开展免疫聚焦型疫苗设计和相关广谱中和抗体的应用开发提供了理论依据 （发表于 Nat. Commun., 2023）。 

2、通过对基因编辑工具蛋白进行结构指导的工程改造，我们参与创建并优化了多种精准高效的新型基因编辑（包括碱基编辑与导向编辑）系统（分别发表于 Cell Res., 2017; Nat. Biotechnol., 2018a; Nat. Biotechnol., 2018b; Cell Rep., 2020; Nat. Cell Biol., 2021; Nat. Commun., 2022）。目前，我们已初步探索了导向编辑技术在高风险传染性疾病的预防方向的应用潜力（发表于 Medcomm., 2023），正与合作者一同推动新型碱基编辑技术在遗传性疾病（如地中海贫血、高血脂症等）治疗中的实际应用（部分临床前成果发表于 Cell Stem Cell, 2023）。

3、我们发掘了人冠状病毒刺突蛋白的HR1基序作为广谱抗冠状病毒作用靶点的潜力（发表于 Acta Crystallogr. D, 2018），并在此基础上与合作者共同开发出了一种广谱抗冠状病毒抑制肽（发表于 Sci. Adv., 2019）。该抑制肽作为HR2基序的模拟物，以HR1基序为靶点，在动物实验中对多种人冠状病毒的感染表现出较好的抑制效果。在上述工作的基础上，我们继续描绘了α属冠状病毒刺突蛋白的抗原图谱，揭示了不同属的人冠状病毒的刺突蛋白之间在抗原特性上的共性与差异，为开发广谱冠状病毒疫苗提供了理论信息（发表于 Commun. Biol., 2022）。

4、3C蛋白是肠道病毒属（Enterovirus）病毒药物开发的热点之一。我们发现，3C蛋白除具有传统的蛋白酶功能外还在该属病毒的基因组复制过程中发挥了关键调控作用，并鉴定出了3C蛋白上负责与病毒基因组结合的全新可靶向位点。该新靶点具有很高的病毒属内保守性，可望用于指导后续针对该属病毒的广谱抑制剂研发工作（发表于PNAS, 2020）。目前，我们正在针对这一新可靶位点开展小分子化合物的筛选与验证工作。